Micro-Manager

Micro-Manager помогает управлять микроскопом и камерой из единого рабочего окна: делать одиночные кадры и живой просмотр, задавать экспозицию, биннинг и область интереса, переключать каналы и оптические состояния, перемещать XY- и Z-столы, запускать автофокус, собирать серии по времени, глубине и нескольким позициям, сохранять многомерные наборы изображений и контролировать результат через гистограммы, метаданные и инструменты ImageJ.

Volocity

Volocity помогает собирать, просматривать и анализировать многоканальные микроскопические изображения: в программе можно формировать 3D- и 4D-наборы, настраивать каналы и LUT, выполнять деконволюцию, находить и измерять объекты, оценивать колокализацию, строить треки и готовить снимки, таблицы, графики и фильмы для публикации.

Orbit Image Analysis

Orbit Image Analysis помогает количественно анализировать микроскопические и полноформатные гистологические изображения: размечать области интереса, обучать классификацию тканей, сегментировать и классифицировать клетки и другие объекты, строить маски и исключающие области, измерять площадь, интенсивность и геометрические признаки, а затем применять сохранённые модели к серии снимков.

OMERO.insight

OMERO.insight помогает импортировать микроскопические изображения в OMERO, систематизировать их по проектам и наборам, просматривать многоканальные Z-стеки и временные серии, настраивать каналы и яркость, работать с метаданными, тегами и ROI, а также получать базовые измерения интенсивности.

Aperio ImageScope

Aperio ImageScope позволяет открывать гигапиксельные цифровые гистологические слайды, быстро перемещаться по ткани с панорамированием и изменением увеличения, сопоставлять несколько препаратов, измерять структуры, размечать области интереса, настраивать яркость, контраст и цвет, работать с Z-стеками и многоканальной флуоресценцией, сохранять снимки и извлекать выбранные фрагменты изображения; основные инструменты собраны вокруг окна просмотра, панели аннотаций, миниатюры слайда, шкалы увеличения и команд анализа.